在《名侦探柯南》这部经典的日本推理动漫中，主线剧情虽然复杂且分支众多，但整体上依然围绕着几个核心线索展开。这些线索不仅串联起了整个故事，也让观众对案件背后的真相充满期待。

首先，贯穿全剧的核心线索之一是黑衣组织。这个神秘的犯罪集团从故事初期就一直存在，并通过各种方式影响着案件的发展。无论是通过间接手段制造案件，还是直接参与其中，黑衣组织始终是一个令人捉摸不透的存在。随着剧情推进，我们逐渐了解到组织成员的身份以及他们的目标，同时也见证了主角们如何一步步接近真相。

其次，工藤新一与毛利兰之间的感情线也是推动剧情发展的重要因素之一。作为故事的主要人物，新一与兰的感情经历了许多波折。从最初的误会到后来的相互理解和支持，这段关系不仅增加了作品的情感深度，也成为了激励新一不断前进的动力源泉。

此外，少年侦探团的活动也为剧情增添了不少趣味性和紧张感。由灰原哀、圆谷光彦和步美组成的少年侦探团，在协助柯南解决案件的过程中展现了非凡的智慧与勇气。他们之间的互动既轻松幽默又不失严肃认真，为整个故事注入了更多的活力。

最后不得不提的是，警方和其他角色的帮助同样不可或缺。无论是东京警视厅的搜查一课，还是其他配角们的协助，都为案件的最终解决提供了重要支持。这些角色各自发挥特长，在关键时刻展现出专业素养，使得故事更加丰富多彩。

综上所述，《名侦探柯南》以其紧凑的情节设计、鲜明的人物形象以及深刻的主题内涵赢得了全球范围内无数粉丝的喜爱。通过对以上几条主要线索的梳理可以看出，尽管该作涉及大量案件，但其核心始终围绕着正义战胜邪恶这一永恒主题展开，让读者在享受推理乐趣的同时也能感受到人性的美好。